Par sa longueur de 4 700 km, le fleuve Congo est le huitième plus long fleuve du monde et deuxième après l'Amazone par son débit moyen de 50 000 m³ par seconde et l'étendue de son bassin de 3 700 000 km2.
Il prend sa source à Lwalaba, sur le haut plateau du Katanga, et se jette dans l'océan Atlantique. Il reçoit ses deux principaux affluents, l'Oubangui, réunion de l'Uele et du Mbomou, et le Kasaï, grossi par le Kwango, avant d'atteindre le Malebo Pool sur les rives duquel Kinshasa et Brazzaville se font face.

De nombreux autres cours d'eau irriguent l'intégralité du territoire : la Lubundi, la Lufira, la Lomami, la Mongala, la Lulonga, l'Ikelemba, ainsi que le Sankuru, la Lukénie, le Kwango, la Maï-Ndombe, la N'djili, etc.

Les principaux lacs de la République Démocratique du Congo sont généralement répartis en trois groupes :

Les lacs de plateaux (Moero, Tshangalele, Upemba et Delcommune)
Les lacs résiduels (Tumba, Mai-Ndombe)
Les lacs de montagnes (Tanganyika, Kivu, Édouard et Albert)